Indigoides
La mayor parte del colorante índigo se obtiene sintéticamente. De forma natural se obtiene de las hojas de la planta del índigo. El índigo (alizacina) es un colorante de cuba o tina, insoluble en agua y en álcalis fuertes, por lo que no se puede aplicar directamente a los tejidos. Convertido en un leuco-compuesto es soluble (blanco de índigo), el proceso de oxidación al sacarlo del agua lo vuelve azul.

Betalaínas
Son características en el orden Caryophyllales, cumplen la misma misión que las antocianinas, y son excluyentes. Se pueden separar en betacianinas (rojo púrpura) y betaxantinas (amarillas), derivados del ácido betalámico. Son hidrosolubles. Su color no depende del pH en márgenes no extremos. La betamina o betalaína de la remolacha se incluye como aditivo alimentario con el código E162. En los frutos de la chumbera aparece la indicaxantina, una betaxantina.

Pigmentos amarillos de alcaloides

• Berberina: en Berberidaceae, Rutaceae, Ranunculaceae, Papaveraceae.
• Sanguinarina: en Sanguinaria canadensis.